2025年7月31日に総務省で発表された長崎県ふるさと納税件数ランキング1位は佐世保市で10万1212件、2位は松浦市で10万140件、3位は南島原市で10万116件、最下位は小値賀町で2,254件となっている。2008～2024年までの長崎県ふるさと納税件数ランキング推移グラフ及びふるさと納税件数長崎県ランキング一覧は以下の通りです。
| 自治体 | 長崎県 | 全国順位 | ふるさと納税件数 |
|---|---|---|---|
| 佐世保市 | 1位 | 134位 | 10万1212件 |
| 松浦市 | 2位 | 137位 | 10万140件 |
| 南島原市 | 3位 | 138位 | 10万116件 |
| 島原市 | 4位 | 225位 | 5万9721件 |
| 波佐見町 | 5位 | 226位 | 5万9440件 |
| 時津町 | 6位 | 331位 | 4万124件 |
| 雲仙市 | 7位 | 341位 | 3万9241件 |
| 長崎市 | 8位 | 342位 | 3万8661件 |
| 諫早市 | 9位 | 382位 | 3万4814件 |
| 五島市 | 10位 | 415位 | 3万912件 |
| ※長崎県 | 11位 | 486位 | 2万5069件 |
| 西海市 | 12位 | 504位 | 2万4287件 |
| 壱岐市 | 13位 | 574位 | 2万382件 |
| 平戸市 | 14位 | 682位 | 1万5660件 |
| 大村市 | 15位 | 711位 | 1万4837件 |
| 東彼杵町 | 16位 | 740位 | 1万3749件 |
| 長与町 | 17位 | 760位 | 1万3191件 |
| 対馬市 | 18位 | 773位 | 1万2967件 |
| 新上五島町 | 19位 | 832位 | 1万866件 |
| 川棚町 | 20位 | 1029位 | 6,278件 |
| 佐々町 | 21位 | 1209位 | 3,564件 |
| 小値賀町 | 22位 | 1345位 | 2,254件 |